Біоінформаційний пошук генів канабіноїдності у конопель

Abstract

Проведено аналіз двох генів канабіноїдності (ТГК та КБД синтази) за допомогою пакету BioEdit і вбудованих інструментів бази даних NCBI. В базі даних NCBI було відібрано 36 повних кодуючих послідовностей нукліотидів. Отримано філогенетичне дерево для цих послідовностей. Сконструйовано діагностичні праймери, розраховано та проведено ПЛР in silico для аналізу цільових генів канабіноїдності. Для ампліфікування фрагментів генів праймери для ПЛР розроблені за допомогою програми AmplifiX. Підтверджена еволюційна спорідненість КБД і ТГК синтази.

An analysis of two cannabinoid genes (THC and CBD synthase) was carried out using the BioEdit package and NCBI database tools. In the NCBI database, 36 new coding sequences of nucleotides were selected. A phylogenetic tree for these sequences was taken away. A diagnostic primer was designed, it was secured and carried out in silico PCR for the analysis of whole cannabinoid genes. For amplification of fragments of genes, primers for PLR are disassembled using the additional program AmplifiX. Evolutionary controversy of CBD and THC synthase has been confirmed.