Біоінформаційний пошук потенційних генів чоловічої стерильності амаранту

Abstract

Виділено 9 послідовностей генів чоловічої стерильності у різних сільськогосподарських культур. Ідентифіковано 5 послідовностей ДНК генівкандидатів чоловічої стерильності у амаранту. Встановлено значний поліморфізм знайдених послідовностей (dtn варіювало від 0,677 до 2,478). Відзначено суттєвий рівень генетичної дивергенції між ними. Розроблено дві пари діагностичних праймерів, які можуть бути використані у маркерасоційованій селекції амаранту на гетерозис, а також для подальшого дослідження проблем чоловічої стерильності у амаранту. Під час ПЛР in silico з використанням розроблених праймерів утворювалися фрагменти довжиною 1286 і 1518 нуклеотидів.

9 strategies of male sterility genes in various agricultural crops have been identified. Five DNA components of male sterility candidate genes in amaranth were identified. A significant polymorphism of the diseases found was established (dtn varied from 0.677 to 2.478). A significant level of genetic divergence between them was noted. Two pairs of diagnostic primers were developed, which can be used in marker-associated selection of amaranth for heterosis, as well as for further research on the problem of male sterility in amaranth. During in silico PCR using the developed primers, fragments with a length of 1286 and 1518 nucleotides were formed.